論文の概要: Temporally Phenotyping GLP-1RA Case Reports with Large Language Models: A Textual Time Series Corpus and Risk Modeling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.06197v1
- Date: Thu, 12 Mar 2026 20:45:06 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-12 18:41:08.620304
- Title: Temporally Phenotyping GLP-1RA Case Reports with Large Language Models: A Textual Time Series Corpus and Risk Modeling
- Title(参考訳): GLP-1RAにおける大規模言語モデルを用いた時間的表現:テキスト時系列コーパスとリスクモデリング
- Authors: Sayantan Kumar, Jeremy C. Weiss,
- Abstract要約: グルカゴン様ペプチド1受容体アゴニストを含む症例報告の時系列コーパスを開発した。
臨床領域の専門家によるゴールド・スタンダード・タイムラインに対するLPMタイムラインの自動抽出について検討した。
最高の性能のLCMは、高いイベントカバレッジ、症状、診断、治療、検査、結果の信頼できる時間的シークエンシングを実現した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.6611037112655818
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Type 2 diabetes case reports describe complex clinical courses, but their timelines are often expressed in language that is difficult to reuse in longitudinal modeling. To address this gap, we developed a textual time-series corpus of 136 PubMed Open Access single-patient case reports involving glucagon-like peptide 1 receptor agonists, with clinical events associated with their most probable reference times. We evaluated automated LLM timeline extraction against gold-standard timelines annotated by clinical domain experts, assessing how well systems recovered clinical events and their timings. The best-performing LLM produced high event coverage (GPT5; 0.871) and reliable temporal sequencing across symptoms (GPT5; 0.843), diagnoses, treatments, laboratory tests, and outcomes. As a downstream demonstration, time-to-event analyses in diabetes suggested lower risk of respiratory sequelae among GLP-1 users versus non-users (HR=0.259, p<0.05), consistent with prior reports of improved respiratory outcomes. Temporal annotations and code will be released upon acceptance.
- Abstract(参考訳): 2型糖尿病の症例報告は複雑な臨床経過を記述しているが, 経時的モデリングでは再利用が困難である言語で表されることが多い。
このギャップを解消するために,グルカゴン様ペプチド1受容体アゴニストを主訴とした1例136件のPubMed Open Accessのテキスト・シリーズ・コーパスを作成した。
臨床領域の専門家によるゴールド・スタンダード・タイムラインに対する自動LCMタイムライン抽出の評価を行い,臨床イベントの回復状況とそのタイミングについて検討した。
成績の良いLSMは,高頻度の事象カバレッジ (GPT5, 0.871) と症状間の時間的シークエンシング (GPT5, 0.843), 診断, 治療, 検査, 結果の信頼性を示した。
その結果, GLP-1使用者(HR=0.259, p<0.05)と非使用者(HR=0.259, p<0.05)の呼吸後遺症リスクの低下が示唆された。
一時的なアノテーションとコードは受け入れ次第リリースされる。
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