論文の概要: FlatASCEND: Autoregressive Clinical Sequence Generation with Continuous Time Prediction and Association-Based Pharmacological Testing
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.04071v1
- Date: Mon, 13 Apr 2026 11:43:51 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-11 06:56:26.56648
- Title: FlatASCEND: Autoregressive Clinical Sequence Generation with Continuous Time Prediction and Association-Based Pharmacological Testing
- Title(参考訳): FlatASCEND:連続時間予測とアソシエーションに基づく薬理学的検査による自己回帰型臨床シーケンス生成
- Authors: Chris Sainsbury, Feng Dong, Andreas Karwath,
- Abstract要約: 平坦な複合トークンを用いた14.5Mパラメータ自己回帰臨床シーケンスモデルであるFlatASCENDと、ゼロインフレーションされた対数正規時間ヘッドを提案する。
プロンプトシャッフルアブレーションは、患者固有の条件付けが機械的薬理学的効果を増幅することを示している。
生成的証拠は短水平ICUデータにとって最強であり、外来患者の時間的忠実度は弱くなっている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.7865154997539017
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Autoregressive models can predict clinical events, but generating patient-conditioned multi-step trajectories that respond to intervention tokens and testing whether those responses preserve known pharmacological associations has received limited attention. We present FlatASCEND, a 14.5M-parameter autoregressive clinical sequence model using flat composite tokens and a zero-inflated log-normal time head. Standard distributional metrics (Jaccard 0.889-0.954) do not distinguish FlatASCEND from trivial baselines; the model's value lies in conditional generation from patient-specific prefixes. A prompt-shuffle ablation shows patient-specific conditioning amplifies mechanistic pharmacological effects (2.0-2.2x for steroid to glucose, diuretic to potassium) while leaving confounding-driven associations unchanged (0.9x for insulin to glucose). An incident-user framework assesses directional consistency against prior pharmacological knowledge on MIMIC-IV (N=500 per comparison): 4/10 recover correct mechanistic directions, 2 reproduce treatment-context associations, 4 are incorrect (9/10 significant, Wilcoxon p<0.05). This pattern - partial recovery under residual confounding - is consistent with learned observational associations without causal distinction. Direct preference optimisation with surrogate reward destroys all correct associations (3/3 to 0/3), illustrating reward exploitation when reward and evaluation share an outcome domain. Generative evidence is strongest for short-horizon ICU data; outpatient temporal fidelity is weaker (median 10 vs 154 days on INSPECT), and zero-shot cross-site transfer degrades without adaptation.
- Abstract(参考訳): 自己回帰モデルは臨床事象を予測できるが、介入トークンに反応する患者条件の多段階の軌跡を生成し、これらの反応が既知の薬理学的関連性を維持するかどうかを検査する。
平らな複合トークンを用いた14.5Mパラメトリック自己回帰臨床モデルであるFlatASCENDと、ゼロインフレーションされた対数正規時間ヘッドについて述べる。
標準的な分布指標(Jaccard 0.889-0.954)は、FlatASCENDを自明なベースラインと区別しない。
プロンプトシャッフルアブレーションは、患者特異的な条件付けによって機械薬理学的効果(ステロイドからグルコースへ2.0-2.2x、利尿剤からカリウムへ0.9x)が増幅され、コンバウンディング駆動の関連性は変化しない(インスリンからグルコースへ0.9x)。
インシデント・ユーザ・フレームワークは、MIMIC-IVの薬理学知識に対する方向性の整合性を評価する(N=500)。4/10は正しい機械的方向を回復し、2は治療コンテキスト関連を再現し、4は誤り(9/10は重要、Wilcoxon p<0.05)。
このパターンは、残差による部分的回復であり、因果区別のない学習された観察的関連と一致している。
代理報酬による直接選好最適化は、すべての正しい関連(3/3〜0/3)を破壊し、報酬と評価が結果領域を共有する場合の報奨利用を図示する。
InSPECTでは10日と154日で外来の時間的忠実度が低下し,適応なくゼロショットのクロスサイト転送は低下する。
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