論文の概要: ARMD-Predict: multi-site machine learning to predict antibiotic resistance before culture results
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2610.32998v1
- Date: Tue, 06 Oct 2026 01:29:28 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-11-02 06:06:26.123901
- Title: ARMD-Predict: multi-site machine learning to predict antibiotic resistance before culture results
- Title(参考訳): ARMD予測:マルチサイト機械学習による抗生物質耐性の予測
- Abstract要約: 臨床医は、培養感受性試験が利用可能になる前に、経験的抗生物質を選択する。
我々は,4つの学術的医療センターから75万の培養抗生物質を観察し,ARMD予測を開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 25.730783046694583
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Clinicians select empiric antibiotics before culture susceptibility results are available. Electronic health record (EHR) models could inform that choice, but most are developed at a single hospital and transport poorly to others. We developed ARMD-Predict using 7.5 million culture-antibiotic observations from four academic medical centers. One set of models estimates susceptibility to individual antibiotics; a second, hierarchical set predicts the infecting organism and then organism-specific resistance phenotypes. Across 23 pooled susceptibility models evaluated in same-period, patient-grouped test partitions, median area under the receiver operating characteristic curve (AUROC) was 0.77 for inpatient urine and 0.70 for inpatient blood cultures; chronological retraining reduced AUROC by approximately 0.04. At an exploratory threshold with 95% positive predictive value, derived and evaluated on the same test observations, the model identified 55% of ceftriaxone-susceptible inpatient urine observations as suitable for narrower therapy and flagged 60% of ceftriaxone-resistant observations for broader coverage. Organism classifiers achieved top-3 accuracy of 51.3-83.3%; phenotype AUROCs were conditional on the observed organism. Research applications are available at https://armd-predict.stanford.edu. Independent calibration, threshold and end-to-end prospective validation are required before clinical use.
- Abstract(参考訳): 臨床医は、培養感受性試験が利用可能になる前に、経験的抗生物質を選択する。
電子健康記録(EHR)モデルは、その選択を知らせる可能性があるが、そのほとんどは単一の病院で開発され、他者への輸送が不十分である。
我々は,4つの学術的医療センターから75万の培養抗生物質を観察し,ARMD予測を開発した。
1組のモデルでは、個々の抗生物質に対する感受性を推定し、2つめの階層的なセットは、感染する生物と、それから生物固有の抵抗性表現型を予測する。
同一期間, 患者群別試験区, 受信者操作特性曲線 (AUROC) の中央値が0.77例, 入院血液培養では0.70例であり, 時間的再トレーニングによりAUROCは約0.04例減少した。
同じ検査結果から95%の正の予測値を持つ探索しきい値において, 患者尿中セフトラクソン感受性の55%は, より狭い治療に適しており, 広範囲にわたってセフトラクソン耐性の60%はフラグ付きであった。
生物分類器は51.3-83.3%で、表現型AUROCは観察された生物に条件付きである。
研究アプリケーションはhttps://armd-predict.stanford.edu.comで公開されている。
臨床使用の前には、独立した校正、しきい値、エンドツーエンドの検証が必要である。
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