論文の概要: The huge Package for High-dimensional Undirected Graph Estimation in R
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2006.14781v1
- Date: Fri, 26 Jun 2020 03:36:47 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-16 21:32:08.734605
- Title: The huge Package for High-dimensional Undirected Graph Estimation in R
- Title(参考訳): r における高次元非有向グラフ推定のための巨大パッケージ
- Authors: Tuo Zhao, Han Liu, Kathryn Roeder, John Lafferty, Larry Wasserman
- Abstract要約: 本稿では,データから高次元の非方向グラフを推定するための使い勝手の良い関数を提供する「Big」というRパッケージについて述べる。
既存のグラフ推定パッケージのガラスと比較すると、巨大なパッケージは追加機能を提供します。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.59497498272163
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We describe an R package named huge which provides easy-to-use functions for
estimating high dimensional undirected graphs from data. This package
implements recent results in the literature, including Friedman et al. (2007),
Liu et al. (2009, 2012) and Liu et al. (2010). Compared with the existing graph
estimation package glasso, the huge package provides extra features: (1)
instead of using Fortan, it is written in C, which makes the code more portable
and easier to modify; (2) besides fitting Gaussian graphical models, it also
provides functions for fitting high dimensional semiparametric Gaussian copula
models; (3) more functions like data-dependent model selection, data generation
and graph visualization; (4) a minor convergence problem of the graphical lasso
algorithm is corrected; (5) the package allows the user to apply both lossless
and lossy screening rules to scale up large-scale problems, making a tradeoff
between computational and statistical efficiency.
- Abstract(参考訳): 本稿では,データから高次元の非方向グラフを推定するための使い勝手の良い関数を提供する。
このパッケージは、Friedman et al. (2007)、Liu et al. (2009, 2012)、Liu et al. (2010)など、最近の文献での結果を実装している。
Compared with the existing graph estimation package glasso, the huge package provides extra features: (1) instead of using Fortan, it is written in C, which makes the code more portable and easier to modify; (2) besides fitting Gaussian graphical models, it also provides functions for fitting high dimensional semiparametric Gaussian copula models; (3) more functions like data-dependent model selection, data generation and graph visualization; (4) a minor convergence problem of the graphical lasso algorithm is corrected; (5) the package allows the user to apply both lossless and lossy screening rules to scale up large-scale problems, making a tradeoff between computational and statistical efficiency.
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