論文の概要: SBI -- A toolkit for simulation-based inference
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2007.09114v2
- Date: Wed, 22 Jul 2020 15:43:36 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-11-09 13:30:39.742453
- Title: SBI -- A toolkit for simulation-based inference
- Title(参考訳): SBI -- シミュレーションベースの推論ツールキット
- Authors: Alvaro Tejero-Cantero (1), Jan Boelts (1), Michael Deistler (1),
Jan-Matthis Lueckmann (1), Conor Durkan (2), Pedro J. Gon\c{c}alves (1, 3),
David S. Greenberg (1, 4) and Jakob H. Macke (1, 5, 6) ((1) Computational
Neuroengineering, Department of Electrical and Computer Engineering,
Technical University of Munich, (2) School of Informatics, University of
Edinburgh, (3) Neural Systems Analysis, Center of Advanced European Studies
and Research (caesar), Bonn, (4) Model-Driven Machine Learning, Centre for
Materials and Coastal Research, Helmholtz-Zentrum Geesthacht, (5) Machine
Learning in Science, University of T\"ubingen, (6) Empirical Inference, Max
Planck Institute for Intelligent Systems, T\"ubingen)
- Abstract要約: シミュレーションベースの推論 (SBI) は、a) が先行知識と互換性があり、b) が経験的観察と一致するパラメータ集合を識別しようとする。
ニューラルネットワークに基づくSBIアルゴリズムを実装したPyTorchベースのパッケージであるtextttsbi$を提示する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/
- Abstract: Scientists and engineers employ stochastic numerical simulators to model
empirically observed phenomena. In contrast to purely statistical models,
simulators express scientific principles that provide powerful inductive
biases, improve generalization to new data or scenarios and allow for fewer,
more interpretable and domain-relevant parameters. Despite these advantages,
tuning a simulator's parameters so that its outputs match data is challenging.
Simulation-based inference (SBI) seeks to identify parameter sets that a) are
compatible with prior knowledge and b) match empirical observations.
Importantly, SBI does not seek to recover a single 'best' data-compatible
parameter set, but rather to identify all high probability regions of parameter
space that explain observed data, and thereby to quantify parameter
uncertainty. In Bayesian terminology, SBI aims to retrieve the posterior
distribution over the parameters of interest. In contrast to conventional
Bayesian inference, SBI is also applicable when one can run model simulations,
but no formula or algorithm exists for evaluating the probability of data given
parameters, i.e. the likelihood. We present $\texttt{sbi}$, a PyTorch-based
package that implements SBI algorithms based on neural networks. $\texttt{sbi}$
facilitates inference on black-box simulators for practising scientists and
engineers by providing a unified interface to state-of-the-art algorithms
together with documentation and tutorials.
- Abstract(参考訳): 科学者や技術者は確率的数値シミュレータを使って経験的に観測された現象をモデル化する。
純粋に統計的モデルとは対照的に、シミュレーターは強力な帰納バイアスを与える科学的原理を表現し、新しいデータやシナリオへの一般化を改善し、より小さく、より解釈可能な、ドメイン関連パラメータを許容する。
これらの利点にもかかわらず、その出力がデータにマッチするようにシミュレータのパラメータをチューニングすることは困難である。
シミュレーションベース推論(SBI)はパラメータ集合を識別する。
a)事前の知識と互換性があり
b) 経験的な観察と一致する。
重要なことは、SBIは単一の「ベスト」なデータ互換パラメータセットを復元するのではなく、観察されたデータを説明するパラメータ空間の全ての高い確率領域を特定し、パラメータの不確かさを定量化する。
ベイズ用語では、SBIは興味のあるパラメータの後方分布を検索することを目的としている。
従来のベイズ推定とは対照的に、sbiはモデルシミュレーションを実行する場合にも適用できるが、与えられたパラメータ、すなわち確率を評価する公式やアルゴリズムは存在しない。
我々は、ニューラルネットワークに基づくSBIアルゴリズムを実装するPyTorchベースのパッケージである$\texttt{sbi}$を提示する。
$\texttt{sbi}$は、ドキュメンテーションやチュートリアルとともに最先端アルゴリズムへの統一インターフェースを提供することで、科学者やエンジニアを実践するためのブラックボックスシミュレータの推論を容易にする。
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$texttsbi$は、ニューラルネットワークに基づいたベイズSBIアルゴリズムを実装するPyTorchベースのパッケージである。
texttsbi$ツールキットを使えば、科学者やエンジニアが最先端のSBIメソッドをブラックボックスシミュレータに適用できる。
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