論文の概要: Quantitative Prediction on the Enantioselectivity of Multiple Chiral
Iodoarene Scaffolds Based on Whole Geometry
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2103.14065v1
- Date: Thu, 25 Mar 2021 20:08:56 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-03-29 12:28:23.688201
- Title: Quantitative Prediction on the Enantioselectivity of Multiple Chiral
Iodoarene Scaffolds Based on Whole Geometry
- Title(参考訳): 全形状に基づく複数のキラルヨードアレンのエナンチオ選択性に関する定量的予測
- Authors: Prema Dhorma Lama, Surendra Kumar, Kang Kim, Sangjin Ahn, Mi-hyun Kim
- Abstract要約: 名前反応におけるキラル触媒の反応範囲を拡張するための予測ワークフローを提案する。
複数の触媒足場の3D構造を最適化したDFTから全ジオメトリディスクリプタをエンコードした。
アンサンブルモデルのコンセンサス予測のために、このグローバルディスクリプタは、ステリモールパラメータおよび非共有相互作用と比較することができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.042350304426974
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The mechanistic underpinnings of asymmetric catalysis at atomic levels
provide shortcuts for developing the potential value of chiral catalysts beyond
the current state-of-the-art. In the enantioselective redox transformations,
the present intuition-driven studies require a systematic approach to support
their intuitive idea. Arguably, the most systematic approach would be based on
the reliable quantitative structure-selectivity relationship of diverse and
dissimilar chiral scaffolds in an optimal feature space that is universally
applied to reactions. Here, we introduce a predictive workflow for the
extension of the reaction scope of chiral catalysts across name reactions. For
this purpose, whole geometry descriptors were encoded from DFT optimized 3D
structures of multiple catalyst scaffolds, 113 catalysts in 9 clusters. The
molecular descriptors were verified by the statistical comparison of the
enantioselective predictive classification models built from each descriptors
of chiral iodoarenes. More notably, capturing the whole molecular geometry
through one hot encoding of split three-dimensional molecular fingerprints
presented reliable enantioselective predictive regression models for three
different name reactions by recycling the data and metadata obtained across
reactions. The potential use value of this workflow and the advantages of
recyclability, compatibility, and generality proved that the workflow can be
applied for name reactions other than the aforementioned name reactions (out of
samples). Furthermore, for the consensus prediction of ensemble models, this
global descriptor can be compared with sterimol parameters and noncovalent
interaction vectors. This study is one case showing how to overcome the
sparsity of experimental data in organic reactions, especially asymmetric
catalysis.
- Abstract(参考訳): 原子レベルでの非対称触媒の力学的基盤は、現在の最先端を超えるキラル触媒の潜在的な価値を開発するためのショートカットを提供する。
エナンチオ選択的レドックス変換において、現在の直観的研究は直観的アイデアを支持する体系的なアプローチを必要とする。
おそらく最も体系的なアプローチは、反応に普遍的に適用される最適な特徴空間において、多様で異種なキラルな足場の信頼できる定量的構造-選択性関係に基づいているだろう。
本稿では, 名前反応におけるキラル触媒の反応範囲を拡張するための予測ワークフローを紹介する。
この目的のために、DFT最適化された複数の触媒足場113個の触媒からなる3次元構造から、全幾何学記述子を符号化した。
分子ディスクリプタはキラルヨードアレンの各ディスクリプタから構築されたエナンチオ選択的予測分類モデルの統計的比較により検証された。
さらに、分割された3次元分子指紋の1つのホットエンコーディングを通して分子構造全体を捉えることで、3つの異なる名前反応に対する信頼できるエナンチオ選択的予測回帰モデルが得られた。
このワークフローの潜在的な使用価値とリサイクル性、互換性、一般性の利点は、上記の名前反応以外の名前反応にワークフローを適用することができることを示した(サンプルから)。
さらに、アンサンブルモデルのコンセンサス予測では、この大域的記述子は、ステリモールパラメータや非共有相互作用ベクトルと比較することができる。
本研究は, 有機反応, 特に非対称触媒反応における実験データの疎さを克服する方法を示す一例である。
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