論文の概要: PARAFAC2$\times$N: Coupled Decomposition of Multi-modal Data with Drift
in N Modes
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2205.03501v1
- Date: Fri, 6 May 2022 23:22:22 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-05-10 17:33:43.560799
- Title: PARAFAC2$\times$N: Coupled Decomposition of Multi-modal Data with Drift
in N Modes
- Title(参考訳): PARAFAC2$\times$N:Nモードにおけるドリフトを伴う多重モードデータの結合分解
- Authors: Michael D. Sorochan Armstrong, Jesper L{\o}ve Hinrich, A. Paulina de
la Mata, James J. Harynuk
- Abstract要約: 複数のサンプルに対して、GC$times$GC-TOFMSデータは、I質量スペクトル取得、J質量チャネル、K変調、Lサンプルの4位として表される。
クロマトグラフィードリフトは、第1次元(変調)と第2次元(質量スペクトル取得)の両方で一般的である
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Reliable analysis of comprehensive two-dimensional gas chromatography -
time-of-flight mass spectrometry (GC$\times$GC-TOFMS) data is considered to be
a major bottleneck for its widespread application. For multiple samples,
GC$\times$GC-TOFMS data for specific chromatographic regions manifests as a 4th
order tensor of I mass spectral acquisitions, J mass channels, K modulations,
and L samples. Chromatographic drift is common along both the first-dimension
(modulations), and along the second-dimension (mass spectral acquisitions),
while drift along the mass channel and sample dimensions is for all practical
purposes nonexistent. A number of solutions to handling GC$\times$GC-TOFMS data
have been proposed: these involve reshaping the data to make it amenable to
either 2nd order decomposition techniques based on Multivariate Curve
Resolution (MCR), or 3rd order decomposition techniques such as Parallel Factor
Analysis 2 (PARAFAC2). PARAFAC2 has been utilised to model chromatographic
drift along one mode, which has enabled its use for robust decomposition of
multiple GC-MS experiments. Although extensible, it is not straightforward to
implement a PARAFAC2 model that accounts for drift along multiple modes. In
this submission, we demonstrate a new approach and a general theory for
modelling data with drift along multiple modes, for applications in
multidimensional chromatography with multivariate detection.
- Abstract(参考訳): 包括的2次元ガスクロマトグラフィー-飛行時質量分析法(GC$\times$GC-TOFMS)の信頼性解析は、その広範な応用において大きなボトルネックであると考えられている。
複数のサンプルに対して、GC$\times$GC-TOFMSデータは、I質量スペクトル取得の4次テンソル、J質量チャネル、K変調、Lサンプルとして表される。
クロマトグラフィードリフトは、第1次元(変調)と第2次元(質量スペクトル取得)の両方に共通であるが、質量チャネルとサンプル次元に沿ってドリフトは、あらゆる実用的目的のために存在しない。
GC$\times$GC-TOFMSデータを扱うための多くのソリューションが提案されている。これは、多変量曲線分解法(MCR)に基づく2次分解技術とパラレル因子解析法(PARAFAC2)のような3次分解技術のいずれかにデータを変換することである。
PARAFAC2は1つのモードに沿ってクロマトグラフィードリフトをモデル化するために利用され、複数のGC-MS実験の堅牢な分解に利用できるようになった。
拡張性はあるものの、複数のモードに沿ってドリフトするPARAFAC2モデルを実装するのは簡単ではない。
本稿では,多変量検出を用いた多次元クロマトグラフィーにおいて,複数のモードに沿ってドリフトするデータをモデル化するための新しいアプローチと一般理論を示す。
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