Fugu-MT 論文翻訳(概要): NeuralNEB -- Neural Networks can find Reaction Paths Fast

論文の概要: NeuralNEB -- Neural Networks can find Reaction Paths Fast

arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.09971v1
Date: Wed, 20 Jul 2022 15:29:45 GMT
ステータス: 処理完了
システム内更新日: 2022-07-21 14:25:44.707738
Title: NeuralNEB -- Neural Networks can find Reaction Paths Fast
Title（参考訳）: NeuralNEB -- ニューラルネットワークは反応経路を素早く見つけることができる
Authors: Mathias Schreiner, Arghya Bhowmik, Tejs Vegge and Ole Winther
Abstract要約: 960万の密度汎関数理論(DFT)計算を含むデータセットトランジション1xを提案する。 MLモデルは、人気のあるベンチマークデータセットをトレーニングすることでのみ、遷移状態領域の機能を学習できないことを示す。
参考スコア（独自算出の注目度）: 7.7365628406567675
License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
Abstract: Machine Learning (ML) models have, in contrast to their usefulness in molecular dynamics studies, had limited success as surrogate potentials for reaction barrier search. It is due to the scarcity of training data in relevant transition state regions of chemical space. Currently, available datasets for training ML models on small molecular systems almost exclusively contain configurations at or near equilibrium. In this work, we present the dataset Transition1x containing 9.6 million Density Functional Theory (DFT) calculations of forces and energies of molecular configurations on and around reaction pathways at the wB97x/6-31G(d) level of theory. The data was generated by running Nudged Elastic Band (NEB) calculations with DFT on 10k reactions while saving intermediate calculations. We train state-of-the-art equivariant graph message-passing neural network models on Transition1x and cross-validate on the popular ANI1x and QM9 datasets. We show that ML models cannot learn features in transition-state regions solely by training on hitherto popular benchmark datasets. Transition1x is a new challenging benchmark that will provide an important step towards developing next-generation ML force fields that also work far away from equilibrium configurations and reactive systems.
Abstract（参考訳）: 機械学習(ML)モデルは、分子動力学研究において有用であるのとは対照的に、反応障壁探索のサロゲートポテンシャルとして成功した。これは、化学空間の関連する遷移状態領域におけるトレーニングデータの不足に起因する。現在、小さな分子システム上でMLモデルをトレーニングするためのデータセットは、ほぼ平衡に近い構成を含んでいる。本稿では, wb97x/6-31g(d)理論における反応経路とその周辺における分子配置の力とエネルギーの9.6億倍の密度汎関数理論(dft)を含むデータセットtransition1xを提案する。データは、中間計算を節約しながら10k反応でdftを用いたヌッジ弾性バンド(neb)計算を実行して生成された。我々は,人気のani1xおよびqm9データセット上でtransition1xおよびcross-validate上で,最先端の等価グラフメッセージパッシングニューラルネットワークモデルをトレーニングする。 MLモデルは、人気のあるベンチマークデータセットをトレーニングすることでのみ、遷移状態領域の機能を学習できないことを示す。 transition1xは新しい挑戦的なベンチマークで、平衡構成やリアクティブシステムから遠く離れた、次世代のMLフォースフィールドの開発に向けた重要なステップを提供する。

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