論文の概要: Conditioning Normalizing Flows for Rare Event Sampling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2207.14530v1
- Date: Fri, 29 Jul 2022 07:56:10 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-08-01 13:30:54.404140
- Title: Conditioning Normalizing Flows for Rare Event Sampling
- Title(参考訳): 希少イベントサンプリングのための条件付き正規化フロー
- Authors: Sebastian Falkner, Alessandro Coretti, Salvatore Romano, Phillip
Geissler, Christoph Dellago
- Abstract要約: 本稿では,ニューラルネットワーク生成構成に基づく遷移経路サンプリング手法を提案する。
これにより遷移領域の熱力学と運動学の両方を解くことができる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 61.005334495264194
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Understanding the dynamics of complex molecular processes is often linked to
the study of infrequent transitions between long-lived stable states. The
standard approach to the sampling of such rare events is to generate an
ensemble of transition paths using a random walk in trajectory space. This,
however, comes with the drawback of strong correlation between subsequently
visited paths and with an intrinsic difficulty in parallelizing the sampling
process. We propose a transition path sampling scheme based on neural-network
generated configurations. These are obtained employing normalizing flows, a
neural network class able to generate decorrelated samples from a given
distribution. With this approach, not only are correlations between visited
paths removed, but the sampling process becomes easily parallelizable.
Moreover, by conditioning the normalizing flow, the sampling of configurations
can be steered towards the regions of interest. We show that this allows for
resolving both the thermodynamics and kinetics of the transition region.
- Abstract(参考訳): 複雑な分子過程の力学を理解することは、しばしば長寿命の安定状態の間の頻繁な遷移の研究と結びついている。
このようなまれな事象のサンプリングに対する標準的なアプローチは、軌道空間内のランダムウォークを用いて遷移経路のアンサンブルを生成することである。
しかし、これはその後の訪問経路とサンプリングプロセスの並列化が本質的に困難であったこととの強い相関の欠点を伴っている。
ニューラルネットワーク生成構成に基づく遷移経路サンプリング手法を提案する。
これらは、与えられた分布から復号関連サンプルを生成することができるニューラルネットワーククラスである正規化フローを用いて得られる。
このアプローチでは、訪問経路間の相関が除去されるだけでなく、サンプリングプロセスも容易に並列化できる。
さらに、正規化フローを条件付けすることにより、興味のある領域に向けて構成のサンプリングを行うことができる。
これにより遷移領域の熱力学と運動学の両方を解くことができる。
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