論文の概要: Multimodal Interactive Lung Lesion Segmentation: A Framework for Annotating PET/CT Images based on Physiological and Anatomical Cues

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.09914v1
• Date: Tue, 24 Jan 2023 10:50:45 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2023-01-25 13:51:11.220355
• Title: Multimodal Interactive Lung Lesion Segmentation: A Framework for Annotating PET/CT Images based on Physiological and Anatomical Cues
• Title（参考訳）: マルチモーダルインタラクティブ肺病変分割法 : 生理的および解剖学的クイズに基づくPET/CT画像のアノテートのためのフレームワーク
• Authors: Verena Jasmin Hallitschke, Tobias Schlumberger, Philipp Kataliakos, Zdravko Marinov, Moon Kim, Lars Heiliger, Constantin Seibold, Jens Kleesiek, Rainer Stiefelhagen
• Abstract要約: 深層学習は、医療画像における様々な病気の正確なセグメンテーションを可能にした。 しかしながら、これらのパフォーマンスは通常、大量の手動のボクセルアノテーションを必要とする。 PET/CTデータから解剖学と生理学の手がかりを組み合わせることで,これらの問題を緩和する多モード対話型セグメンテーションフレームワークを提案する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 16.159693927845975
• License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
• Abstract: Recently, deep learning enabled the accurate segmentation of various diseases in medical imaging. These performances, however, typically demand large amounts of manual voxel annotations. This tedious process for volumetric data becomes more complex when not all required information is available in a single imaging domain as is the case for PET/CT data. We propose a multimodal interactive segmentation framework that mitigates these issues by combining anatomical and physiological cues from PET/CT data. Our framework utilizes the geodesic distance transform to represent the user annotations and we implement a novel ellipsoid-based user simulation scheme during training. We further propose two annotation interfaces and conduct a user study to estimate their usability. We evaluated our model on the in-domain validation dataset and an unseen PET/CT dataset. We make our code publicly available: https://github.com/verena-hallitschke/pet-ct-annotate.
• Abstract（参考訳）: 近年, 深層学習により, 様々な疾患の正確な分類が可能となった。 しかし、これらのパフォーマンスは通常、大量の手動のvoxelアノテーションを必要とする。 PET/CTデータのように、1つの画像領域で全ての必要な情報が得られない場合には、この面倒なボリュームデータ処理はより複雑になる。 PET/CTデータから解剖学と生理学の手がかりを組み合わせることで,これらの問題を緩和する多モード対話型セグメンテーションフレームワークを提案する。 本フレームワークは,測地距離変換を利用してユーザアノテーションを表現し,訓練中に新しい楕円型ユーザシミュレーションスキームを実装した。 さらに,アノテーションインタフェースを2つ提案し,ユーザビリティを評価するためにユーザ調査を行う。 ドメイン内検証データセットと未確認PET/CTデータセットを用いて,本モデルの評価を行った。 コードを公開しています。 https://github.com/verena-hallitschke/pet-ct-annotate。

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