論文の概要: COSST: Multi-organ Segmentation with Partially Labeled Datasets Using
Comprehensive Supervisions and Self-training
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2304.14030v1
- Date: Thu, 27 Apr 2023 08:55:34 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-04-28 13:56:07.771671
- Title: COSST: Multi-organ Segmentation with Partially Labeled Datasets Using
Comprehensive Supervisions and Self-training
- Title(参考訳): COSST: 包括的スーパービジョンと自己学習を用いた部分ラベル付きデータセットによるマルチ組織セグメンテーション
- Authors: Han Liu, Zhoubing Xu, Riqiang Gao, Hao Li, Jianing Wang, Guillaume
Chabin, Ipek Oguz, Sasa Grbic
- Abstract要約: ディープラーニングモデルは、マルチ組織セグメンテーションにおいて顕著な成功を収めてきたが、典型的には、興味のあるすべての器官に注釈を付けた大規模なデータセットを必要とする。
利用可能な部分ラベル付きデータセットの統一モデルを学習して、そのシナジスティックなポテンシャルを活用する方法については、調査が不可欠である。
本稿では,既存手法の深部分析による部分ラベルセグメンテーションを実証的,体系的に研究する。
我々は,包括的監視信号と自己学習を効果的かつ効率的に統合する,COSSTと呼ばれる新しいトレーニングフレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.619550985050113
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Deep learning models have demonstrated remarkable success in multi-organ
segmentation but typically require large-scale datasets with all organs of
interest annotated. However, medical image datasets are often low in sample
size and only partially labeled, i.e., only a subset of organs are annotated.
Therefore, it is crucial to investigate how to learn a unified model on the
available partially labeled datasets to leverage their synergistic potential.
In this paper, we empirically and systematically study the partial-label
segmentation with in-depth analyses on the existing approaches and identify
three distinct types of supervision signals, including two signals derived from
ground truth and one from pseudo label. We propose a novel training framework
termed COSST, which effectively and efficiently integrates comprehensive
supervision signals with self-training. Concretely, we first train an initial
unified model using two ground truth-based signals and then iteratively
incorporate the pseudo label signal to the initial model using self-training.
To mitigate performance degradation caused by unreliable pseudo labels, we
assess the reliability of pseudo labels via outlier detection in latent space
and exclude the most unreliable pseudo labels from each self-training
iteration. Extensive experiments are conducted on six CT datasets for three
partial-label segmentation tasks. Experimental results show that our proposed
COSST achieves significant improvement over the baseline method, i.e.,
individual networks trained on each partially labeled dataset. Compared to the
state-of-the-art partial-label segmentation methods, COSST demonstrates
consistent superior performance on various segmentation tasks and with
different training data size.
- Abstract(参考訳): ディープラーニングモデルでは、マルチオーガンセグメンテーションが著しく成功したが、一般的には、関心のあるすべての臓器が注釈付きで大規模なデータセットを必要とする。
しかし、医用画像データセットは、しばしばサンプルサイズが低く、部分的にラベル付けされているのみである。
したがって、利用可能な部分ラベル付きデータセットの統一モデルをどのように学習し、それらの相乗的ポテンシャルを活用するかを検討することが重要である。
本稿では,既存手法の詳細な分析による部分ラベルセグメンテーションを実証的かつ体系的に研究し,地上の真理と擬似ラベルの2つの信号を含む3つの異なる種類の監視信号を特定する。
我々は,包括的監視信号と自己学習を効果的かつ効率的に統合する,COSSTと呼ばれる新しいトレーニングフレームワークを提案する。
具体的には、2つの真実に基づく信号を用いて初期統一モデルを訓練し、その後、自己学習を用いて擬似ラベル信号を初期モデルに反復的に組み込む。
信頼できない擬似ラベルによる性能劣化を軽減するため,潜在空間における異常検出による擬似ラベルの信頼性を評価し,各自己学習イテレーションから最も信頼できない擬似ラベルを除外する。
3つの部分ラベル分割タスクのための6つのctデータセットについて広範な実験を行った。
実験の結果,提案したCOSSTはベースライン法,すなわち各部分ラベル付きデータセットでトレーニングされた個々のネットワークに対して,大幅な改善が得られた。
COSSTは、最先端部分ラベルセグメンテーション法と比較して、様々なセグメンテーションタスクと異なるトレーニングデータサイズで一貫した優れた性能を示す。
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