論文の概要: CoactSeg: Learning from Heterogeneous Data for New Multiple Sclerosis Lesion Segmentation

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2307.04513v1
• Date: Mon, 10 Jul 2023 12:20:05 GMT
• ステータス: 処理完了
• システム内更新日: 2023-07-11 13:11:09.358310
• Title: CoactSeg: Learning from Heterogeneous Data for New Multiple Sclerosis Lesion Segmentation
• Title（参考訳）: CoactSeg:新しい多発性硬化症病変分類のための異種データからの学習
• Authors: Yicheng Wu, Zhonghua Wu, Hengcan Shi, Bjoern Picker, Winston Chong, and Jianfei Cai
• Abstract要約: CoactSegモデルは、同じ3つの入力(ベースライン、フォローアップ、そしてそれらの長手脳の差)と同じ3つの出力(対応するオールレシオンとニューレシオン予測)を持つ統一モデルとして設計されている。 実験により,不均質データと提案した長手関係制約を用いることで,新順序と全順序セグメンテーションの両タスクの性能が著しく向上することを示した。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 30.716577845084775
• License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
• Abstract: New lesion segmentation is essential to estimate the disease progression and therapeutic effects during multiple sclerosis (MS) clinical treatments. However, the expensive data acquisition and expert annotation restrict the feasibility of applying large-scale deep learning models. Since single-time-point samples with all-lesion labels are relatively easy to collect, exploiting them to train deep models is highly desirable to improve new lesion segmentation. Therefore, we proposed a coaction segmentation (CoactSeg) framework to exploit the heterogeneous data (i.e., new-lesion annotated two-time-point data and all-lesion annotated single-time-point data) for new MS lesion segmentation. The CoactSeg model is designed as a unified model, with the same three inputs (the baseline, follow-up, and their longitudinal brain differences) and the same three outputs (the corresponding all-lesion and new-lesion predictions), no matter which type of heterogeneous data is being used. Moreover, a simple and effective relation regularization is proposed to ensure the longitudinal relations among the three outputs to improve the model learning. Extensive experiments demonstrate that utilizing the heterogeneous data and the proposed longitudinal relation constraint can significantly improve the performance for both new-lesion and all-lesion segmentation tasks. Meanwhile, we also introduce an in-house MS-23v1 dataset, including 38 Oceania single-time-point samples with all-lesion labels. Codes and the dataset are released at https://github.com/ycwu1997/CoactSeg.
• Abstract（参考訳）: 多発性硬化症(MS)の臨床治療における疾患進展と治療効果を推定するためには,新しい病変セグメンテーションが不可欠である。 しかしながら、高価なデータ取得とエキスパートアノテーションは、大規模ディープラーニングモデルの適用可能性を制限する。 オールレジオンラベルを持つシングルタイムポイントサンプルの収集は比較的容易であるため, 深部モデルの訓練に活用することが, 新たな病変セグメンテーションを改善する上で非常に望ましい。 そこで本研究では,不均一なデータ(ニューレシオンアノテート2点データとオールレシオンアノテート1点データ)を新たなms病変セグメンテーションに活用するためのコアクションセグメンテーション(coactseg)フレームワークを提案する。 coactsegモデルは統一モデルとして設計されており、同じ3つの入力(ベースライン、フォローアップ、およびその縦方向の脳の違い)と、同じ3つの出力(対応するオールレシオンとニューレシオン予測)が、どの種類の異種データを使用しているかに関わらず使用される。 さらに、モデル学習を改善するために、3つの出力間の長手関係を確保するために、単純で効果的な関係正規化を提案する。 広範囲にわたる実験により,不均質データと提案する縦関係制約を用いることで,新レシオンおよび全レシオンセグメンテーションタスクの性能が著しく向上することが示された。 また、Oceaniaシングルタイムポイント38サンプルを含む社内のMS-23v1データセットも導入しました。 コードとデータセットはhttps://github.com/ycwu1997/coactsegでリリースされる。

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