論文の概要: Information geometric bound on general chemical reaction networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.10334v1
- Date: Tue, 19 Sep 2023 05:37:13 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-09-20 16:17:11.510828
- Title: Information geometric bound on general chemical reaction networks
- Title(参考訳): 一般化学反応ネットワーク上の情報幾何結合
- Authors: Tsuyoshi Mizohata, Tetsuya J. Kobayashi, Louis-S. Bouchard, Hideyuki
Miyahara
- Abstract要約: 我々は、自然勾配を用いた情報幾何学的手法を用いて、CRN力学の上限となる非線形系を開発する。
我々は,CRNの特定のクラスにおいて,より高速な収束を示す数値シミュレーションによるアプローチの有効性を検証した。
我々の研究はCRNに焦点を当てているが、自然科学から工学まで分野におけるハイパーグラフの普遍性は、我々の手法がより広範な応用を見出す可能性があることを示唆している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We investigate the dynamics of chemical reaction networks (CRNs) with the
goal of deriving an upper bound on their reaction rates. This task is
challenging due to the nonlinear nature and discrete structure inherent in
CRNs. To address this, we employ an information geometric approach, using the
natural gradient, to develop a nonlinear system that yields an upper bound for
CRN dynamics. We validate our approach through numerical simulations,
demonstrating faster convergence in a specific class of CRNs. This class is
characterized by the number of chemicals, the maximum value of stoichiometric
coefficients of the chemical reactions, and the number of reactions. We also
compare our method to a conventional approach, showing that the latter cannot
provide an upper bound on reaction rates of CRNs. While our study focuses on
CRNs, the ubiquity of hypergraphs in fields from natural sciences to
engineering suggests that our method may find broader applications, including
in information science.
- Abstract(参考訳): 本研究では,反応速度の上限を導出することを目的として,反応ネットワーク(crns)のダイナミクスについて検討する。
この課題は、CRNに固有の非線形性質と離散構造のために困難である。
これに対処するために,自然勾配を用いた情報幾何学的手法を用いて,crnダイナミクスの上限となる非線形システムを開発する。
我々は,CRNの特定のクラスにおいて,より高速な収束を示す数値シミュレーションによるアプローチを検証する。
このクラスは化学反応の数、化学反応の化学量係数の最大値、反応の数によって特徴づけられる。
また,本手法を従来の手法と比較し,CRNの反応速度に上限を与えることができないことを示した。
本研究はCRNに焦点をあてる一方で,自然科学から工学に至るまでの分野におけるハイパーグラフの多用性は,情報科学を含む幅広い応用を見出すことを示唆している。
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