論文の概要: Transferable Learning of Reaction Pathways from Geometric Priors
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2504.15370v1
- Date: Mon, 21 Apr 2025 18:20:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-05-01 01:50:46.599793
- Title: Transferable Learning of Reaction Pathways from Geometric Priors
- Title(参考訳): 幾何学的先行点からの反応経路の伝達可能な学習
- Authors: Juno Nam, Miguel Steiner, Max Misterka, Soojung Yang, Avni Singhal, Rafael Gómez-Bombarelli,
- Abstract要約: MEPINは、反応物や製品からMEPを効率的に予測するスケーラブルな機械学習手法である。
本手法は,反応経路の効率的なデータ駆動予測による大規模化学反応空間の探索を可能にする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.3170830344441016
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Identifying minimum-energy paths (MEPs) is crucial for understanding chemical reaction mechanisms but remains computationally demanding. We introduce MEPIN, a scalable machine-learning method for efficiently predicting MEPs from reactant and product configurations, without relying on transition-state geometries or pre-optimized reaction paths during training. The task is defined as predicting deviations from geometric interpolations along reaction coordinates. We address this task with a continuous reaction path model based on a symmetry-broken equivariant neural network that generates a flexible number of intermediate structures. The model is trained using an energy-based objective, with efficiency enhanced by incorporating geometric priors from geodesic interpolation as initial interpolations or pre-training objectives. Our approach generalizes across diverse chemical reactions and achieves accurate alignment with reference intrinsic reaction coordinates, as demonstrated on various small molecule reactions and [3+2] cycloadditions. Our method enables the exploration of large chemical reaction spaces with efficient, data-driven predictions of reaction pathways.
- Abstract(参考訳): 最小エネルギー経路(MEP)の同定は化学反応機構を理解する上で重要であるが、計算的に要求される。
そこで我々は,MEPINを提案する。MEPINは,過渡状態のジオメトリや事前最適化された反応経路に頼ることなく,反応状態や製品構成からMEPを効率的に予測するためのスケーラブルな機械学習手法である。
このタスクは、反応座標に沿った幾何学的補間から逸脱を予測するものとして定義される。
本課題は, フレキシブルな中間構造を生成する対称性破壊同変ニューラルネットワークに基づく連続的反応経路モデルを用いて解決する。
このモデルはエネルギーベースの目的を用いて訓練され、ジオデシック補間から幾何的先行を初期補間や事前学習目的として組み込むことで効率を向上する。
本手法は, 種々の化学反応を一般化し, 各種小分子反応および[3+2]環付加反応で示されるように, 基準内在的反応座標との正確な一致を実現する。
本手法は,反応経路の効率的なデータ駆動予測による大規模化学反応空間の探索を可能にする。
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