論文の概要: A pragmatic workflow for research software engineering in computational
science
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2310.00960v1
- Date: Mon, 2 Oct 2023 08:04:12 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-10-23 05:16:21.443462
- Title: A pragmatic workflow for research software engineering in computational
science
- Title(参考訳): 計算科学におけるソフトウェア工学研究のための実践的ワークフロー
- Authors: Tomislav Mari\'c, Dennis Gl\"aser, Jan-Patrick Lehr, Ioannis
Papagiannidis, Benjamin Lambie, Christian Bischof, Dieter Bothe
- Abstract要約: コンピュータサイエンス・エンジニアリング(CSE)の大学研究グループには、通常、研究ソフトウェア工学(RSE)のための専用の資金と人員が不足している。
RSEは、持続可能な研究ソフトウェア開発と再現可能な結果から焦点をシフトします。
本稿では,これらの課題に対処し,CSEにおける研究成果の質を向上させるためのRSEワークフローを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: University research groups in Computational Science and Engineering (CSE)
generally lack dedicated funding and personnel for Research Software
Engineering (RSE), which, combined with the pressure to maximize the number of
scientific publications, shifts the focus away from sustainable research
software development and reproducible results. The neglect of RSE in CSE at
University research groups negatively impacts the scientific output: research
data - including research software - related to a CSE publication cannot be
found, reproduced, or re-used, different ideas are not combined easily into new
ideas, and published methods must very often be re-implemented to be
investigated further. This slows down CSE research significantly, resulting in
considerable losses in time and, consequentially, public funding.
We propose a RSE workflow for Computational Science and Engineering (CSE)
that addresses these challenges, that improves the quality of research output
in CSE. Our workflow applies established software engineering practices adapted
for CSE: software testing, result visualization, and periodical cross-linking
of software with reports/publications and data, timed by milestones in the
scientific publication process. The workflow introduces minimal work overhead,
crucial for university research groups, and delivers modular and tested
software linked to publications whose results can easily be reproduced. We
define research software quality from a perspective of a pragmatic researcher:
the ability to quickly find the publication, data, and software related to a
published research idea, quickly reproduce results, understand or re-use a CSE
method, and finally extend the method with new research ideas.
- Abstract(参考訳): cse(university research groups in computational science and engineering)は一般的に、研究ソフトウェア工学(rse)の専門的な資金や人員が欠如しており、科学出版の数を最大化するための圧力と相まって、持続可能な研究ソフトウェア開発と再現可能な結果から焦点を移している。
大学の研究グループにおけるCSEにおけるRSEの無視は、科学的な成果に悪影響を及ぼす:CSE出版物に関連する研究データを含む研究データは、発見、再生、または再使用できず、異なるアイデアを新しいアイデアに簡単に組み込むことができず、公表された方法が更なる研究のために再実装されることがしばしばある。
これによりCSEの研究が大幅に遅くなり、結果として時間的損失が大きくなり、その結果公共資金も大幅に減少する。
本稿では,これらの課題に対処し,CSEにおける研究成果の質を向上する計算科学・工学(CSE)のためのRSEワークフローを提案する。
私たちのワークフローは、CSEに適合する確立したソフトウェアエンジニアリングのプラクティス、すなわち、ソフトウェアテスト、結果の可視化、そして、科学出版プロセスにおけるマイルストーンによってタイムドされたレポート/パブリケーションとデータの定期的なクロスリンクを適用します。
このワークフローは、最小限の作業オーバーヘッドを導入し、大学の研究グループにとって不可欠であり、結果を容易に再現できる出版物に関連するモジュール式でテスト済みのソフトウェアを提供する。
我々は、実用的研究者の観点から研究ソフトウェアの品質を定義し、出版物、データ、ソフトウェアを素早く発見し、その結果を迅速に再現し、CSE法を理解し、再利用し、最終的に新しい研究アイデアで手法を拡張した。
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