論文の概要: Solvation Free Energies from Neural Thermodynamic Integration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2410.15815v1
- Date: Mon, 21 Oct 2024 09:28:46 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-10-22 13:16:10.926812
- Title: Solvation Free Energies from Neural Thermodynamic Integration
- Title(参考訳): ニューラル熱力学統合による解離自由エネルギー
- Authors: Bálint Máté, François Fleuret, Tristan Bereau,
- Abstract要約: 我々は、2つのターゲットハミルトニアン間を補間する神経ネットワークポテンシャルに沿って解離自由エネルギーを計算する。
いくつかのベンチマークシステムで解答自由エネルギーを計算する方法を検証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 19.871787625519513
- License:
- Abstract: We propose to compute solvation free energies via thermodynamic integration along a neural-network potential interpolating between two target Hamiltonians. We use a stochastic interpolant to define an interpolation between the distributions at the level of samples and optimize a neural network potential to match the corresponding equilibrium potential at every intermediate time-step. Once the alignment between the interpolating samples and the interpolating potentials is sufficiently accurate, the free-energy difference between the two Hamiltonians can be estimated using (neural) thermodynamic integration. We validate our method to compute solvation free energies on several benchmark systems: a Lennard-Jones particle in a Lennard-Jones fluid, as well as the insertion of both water and methane solutes in a water solvent at atomistic resolution.
- Abstract(参考訳): 本稿では,2つの対象ハミルトニアン間を補間するニューラルネットワークポテンシャルと熱力学積分による解離自由エネルギーの計算を提案する。
確率補間器を用いて、サンプルレベルの分布間の補間を定義し、ニューラルネットワーク電位を最適化し、中間時間毎に対応する平衡電位に一致させる。
補間試料と補間電位とのアライメントが十分に正確であれば、2つのハミルトニアンの自由エネルギー差を(神経)熱力学積分を用いて推定することができる。
我々は,レナード-ジョーンズ流体中のレナード-ジョーンズ粒子と,水とメタンの溶質を原子分解能で水溶媒中に挿入することの2つのベンチマークシステムを用いて,溶解自由エネルギーを計算する方法を検証する。
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