論文の概要: Advancing Digital Precision Medicine for Chronic Fatigue Syndrome through Longitudinal Large-Scale Multi-Modal Biological Omics Modeling with Machine Learning and Artificial Intelligence
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.15761v1
- Date: Wed, 18 Jun 2025 15:31:26 GMT
- ステータス: 情報取得中
- システム内更新日: 2025-06-24 14:34:45.732218
- Title: Advancing Digital Precision Medicine for Chronic Fatigue Syndrome through Longitudinal Large-Scale Multi-Modal Biological Omics Modeling with Machine Learning and Artificial Intelligence
- Title(参考訳): 慢性疲労症候群に対するデジタル精密医療の適応 : 機械学習と人工知能を用いた大規模多モード生体眼のモデリング
- Authors: Ruoyun Xiong,
- Abstract要約: 筆者らは,ME/CFSの最もリッチな長手マルチオミクスデータセットを用いた,説明可能なDeep LearningフレームワークであるBioMapAIを開発した。
このデータセットには、腸メダゲノミクス、血漿代謝、免疫プロファイリング、血液検査、臨床症状が含まれる。
マルチオミクスを症状マトリックスに接続することにより、BioMapAIは疾患特異的バイオマーカーと症状特異的バイオマーカーの両方を特定し、症状を再構築し、疾患分類における最先端の精度を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
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- Abstract: We studied a generalized question: chronic diseases like ME/CFS and long COVID exhibit high heterogeneity with multifactorial etiology and progression, complicating diagnosis and treatment. To address this, we developed BioMapAI, an explainable Deep Learning framework using the richest longitudinal multi-omics dataset for ME/CFS to date. This dataset includes gut metagenomics, plasma metabolome, immune profiling, blood labs, and clinical symptoms. By connecting multi-omics to a symptom matrix, BioMapAI identified both disease- and symptom-specific biomarkers, reconstructed symptoms, and achieved state-of-the-art precision in disease classification. We also created the first connectivity map of these omics in both healthy and disease states and revealed how microbiome-immune-metabolome crosstalk shifted from healthy to ME/CFS.
- Abstract(参考訳): 我々は、ME/CFSや長鎖COVIDウイルスなどの慢性疾患は多因子性エチオロジーと進行を伴う高い不均一性を示し、診断と治療が複雑である、という一般的な質問を投げかけた。
そこで我々は,ME/CFSのマルチオミクスデータセットを多用した,説明可能なDeep LearningフレームワークであるBioMapAIを開発した。
このデータセットには、腸メダゲノミクス、血漿代謝、免疫プロファイリング、血液検査、臨床症状が含まれる。
マルチオミクスを症状マトリックスに接続することにより、BioMapAIは疾患特異的バイオマーカーと症状特異的バイオマーカーの両方を特定し、症状を再構築し、疾患分類における最先端の精度を達成した。
また、健康状態と疾患状態の両方において、これらのオミクスの最初の接続マップを作成し、マイクロバイオーム免疫メタボロームのクロストークが健康状態からME/CFSにどのように移行したかを明らかにした。
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