論文の概要: Implicit neural representations for accurate estimation of the standard model of white matter
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.15762v1
- Date: Wed, 18 Jun 2025 15:40:42 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-23 19:00:04.77509
- Title: Implicit neural representations for accurate estimation of the standard model of white matter
- Title(参考訳): 白色物質の標準モデルの精度評価のための暗黙的神経表現
- Authors: Tom Hendriks, Gerrit Arends, Edwin Versteeg, Anna Vilanova, Maxime Chamberland, Chantal M. W. Tax,
- Abstract要約: 白色物質の標準モデル(SM)は、軸索内および外水区画からのdMRI信号の寄与を解消することを目的としている。
モデルが高次元であるため、パラメータの退化を緩和するためには、複数のb値と拡散形状を持つ広範囲な取得プロトコルが要求される。
本研究は,入力座標の正弦波符号化による正規化を含む暗黙的ニューラル表現(INR)に基づく新しい推定フレームワークを実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.25128687379089687
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Diffusion magnetic resonance imaging (dMRI) enables non-invasive investigation of tissue microstructure. The Standard Model (SM) of white matter aims to disentangle dMRI signal contributions from intra- and extra-axonal water compartments. However, due to the model its high-dimensional nature, extensive acquisition protocols with multiple b-values and diffusion tensor shapes are typically required to mitigate parameter degeneracies. Even then, accurate estimation remains challenging due to noise. This work introduces a novel estimation framework based on implicit neural representations (INRs), which incorporate spatial regularization through the sinusoidal encoding of the input coordinates. The INR method is evaluated on both synthetic and in vivo datasets and compared to parameter estimates using cubic polynomials, supervised neural networks, and nonlinear least squares. Results demonstrate superior accuracy of the INR method in estimating SM parameters, particularly in low signal-to-noise conditions. Additionally, spatial upsampling of the INR can represent the underlying dataset anatomically plausibly in a continuous way, which is unattainable with linear or cubic interpolation. The INR is fully unsupervised, eliminating the need for labeled training data. It achieves fast inference ($\sim$6 minutes), is robust to both Gaussian and Rician noise, supports joint estimation of SM kernel parameters and the fiber orientation distribution function with spherical harmonics orders up to at least 8 and non-negativity constraints, and accommodates spatially varying acquisition protocols caused by magnetic gradient non-uniformities. The combination of these properties along with the possibility to easily adapt the framework to other dMRI models, positions INRs as a potentially important tool for analyzing and interpreting diffusion MRI data.
- Abstract(参考訳): 拡散磁気共鳴イメージング(dMRI)は組織微細構造の非侵襲的な研究を可能にする。
白色物質の標準モデル(SM)は、軸索内および外水区画からのdMRI信号の寄与を解消することを目的としている。
しかし、モデルが高次元であるため、パラメータの退化を緩和するためには、複数のb値と拡散テンソル形状を持つ広範な取得プロトコルが要求される。
それでも、騒音のため正確な推定は難しいままである。
本研究では,入力座標の正弦波符号化による空間正則化を組み込んだ暗黙的ニューラル表現(INR)に基づく新しい推定フレームワークを提案する。
INR法は, 合成および生体内両方のデータセットを用いて評価し, 立方体多項式, 教師付きニューラルネットワーク, 非線形最小二乗を用いたパラメータ推定との比較を行った。
SMパラメータの推定におけるINR法の精度は,特に低信号対雑音条件において優れていた。
さらに、INRの空間的アップサンプリングは、線形または立方体補間では達成できない、基礎となるデータセットを解剖学的に少なくとも連続的に表現することができる。
INRは完全に教師なしで、ラベル付きトレーニングデータを必要としない。
高速な推論($6分)を達成し、ガウスノイズとリッチノイズの両方に対して堅牢であり、SMカーネルパラメータと球面高調波によるファイバー配向分布関数の合同推定をサポートし、少なくとも8つの非負性制約を課し、磁気勾配非一様性に起因する空間的に変化する取得プロトコルを許容する。
これらの特性と、フレームワークを他のdMRIモデルに容易に適応させる可能性を組み合わせることで、拡散MRIデータを解析し解釈するための潜在的に重要なツールとしてINRを位置づける。
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