論文の概要: Leveraging Pathology Foundation Models for Panoptic Segmentation of Melanoma in H&E Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.13974v1
- Date: Fri, 18 Jul 2025 14:38:25 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-21 20:43:26.323352
- Title: Leveraging Pathology Foundation Models for Panoptic Segmentation of Melanoma in H&E Images
- Title(参考訳): H&E画像における腹腔鏡下黒色腫分離のための病理基盤モデルの構築
- Authors: Jiaqi Lv, Yijie Zhu, Carmen Guadalupe Colin Tenorio, Brinder Singh Chohan, Mark Eastwood, Shan E Ahmed Raza,
- Abstract要約: メラノーマH&E画像における5つの組織クラスのセグメンテーションのための新しい深層学習ネットワークを提案する。
提案手法は,3100万枚の病理像を特徴抽出器としてトレーニングした病理基盤モデルであるVirchow2を利用する。
提案モデルは,PUMAグランドチャレンジの組織セグメント化タスクにおいて,頑健な性能と一般化性を実証し,第1位を達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.058897726957504
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Melanoma is an aggressive form of skin cancer with rapid progression and high metastatic potential. Accurate characterisation of tissue morphology in melanoma is crucial for prognosis and treatment planning. However, manual segmentation of tissue regions from haematoxylin and eosin (H&E) stained whole-slide images (WSIs) is labour-intensive and prone to inter-observer variability, this motivates the need for reliable automated tissue segmentation methods. In this study, we propose a novel deep learning network for the segmentation of five tissue classes in melanoma H&E images. Our approach leverages Virchow2, a pathology foundation model trained on 3.1 million histopathology images as a feature extractor. These features are fused with the original RGB images and subsequently processed by an encoder-decoder segmentation network (Efficient-UNet) to produce accurate segmentation maps. The proposed model achieved first place in the tissue segmentation task of the PUMA Grand Challenge, demonstrating robust performance and generalizability. Our results show the potential and efficacy of incorporating pathology foundation models into segmentation networks to accelerate computational pathology workflows.
- Abstract(参考訳): メラノーマは、急速に進行し、転移能が高い皮膚癌のアグレッシブな形態である。
メラノーマにおける組織形態の正確な特徴付けは予後と治療計画に不可欠である。
しかしながら、ハエマトキシリンとエオシン(H&E)染色スライディング画像(WSI)からの組織領域の手動分割は、労働集約的で、サーバ間変動の傾向が強いため、信頼性の高い自動組織分割法の必要性が示唆されている。
本研究では,メラノーマH&E画像における5つの組織分類のセグメンテーションのための新しい深層学習ネットワークを提案する。
提案手法では,3100万の病理像を特徴抽出としてトレーニングした病理基盤モデルであるVirchow2を利用する。
これらの特徴は元のRGB画像と融合し、エンコーダデコーダセグメンテーションネットワーク(Efficient-UNet)によって処理され、正確なセグメンテーションマップを生成する。
提案モデルはPUMAグランドチャレンジの組織セグメンテーションタスクにおいて第1位を獲得し、堅牢な性能と一般化性を実証した。
本研究は,病理基盤モデルをセグメンテーションネットワークに組み込んで計算病理ワークフローを高速化する可能性と有効性を示す。
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