論文の概要: Semantic Segmentation of iPS Cells: Case Study on Model Complexity in Biomedical Imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2507.21608v1
- Date: Tue, 29 Jul 2025 09:05:01 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-07-30 17:08:55.95609
- Title: Semantic Segmentation of iPS Cells: Case Study on Model Complexity in Biomedical Imaging
- Title(参考訳): iPS細胞のセマンティックセグメンテーション : バイオメディカルイメージングにおけるモデル複合体のケーススタディ
- Authors: Maoquan Zhang, Bisser Raytchev, Xiujuan Sun,
- Abstract要約: We show that a carefullyconfiged DeepLabv3 model can achieved high performance in segmenting induced pluripotent stem (iPS) cell colony。
また、小さなデータセットとドメイン固有のエンコーディングの戦略を含むオープンソース実装も提供しています。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
- Abstract: Medical image segmentation requires not only accuracy but also robustness under challenging imaging conditions. In this study, we show that a carefully configured DeepLabv3 model can achieve high performance in segmenting induced pluripotent stem (iPS) cell colonies, and, under our experimental conditions, outperforms large-scale foundation models such as SAM2 and its medical variant MedSAM2 without structural modifications. These results suggest that, for specialized tasks characterized by subtle, low-contrast boundaries, increased model complexity does not necessarily translate to better performance. Our work revisits the assumption that ever-larger and more generalized architectures are always preferable, and provides evidence that appropriately adapted, simpler models may offer strong accuracy and practical reliability in domain-specific biomedical applications. We also offer an open-source implementation that includes strategies for small datasets and domain-specific encoding, with the aim of supporting further advances in semantic segmentation for regenerative medicine and related fields.
- Abstract(参考訳): 医用画像のセグメンテーションには、精度だけでなく、困難な画像条件下での堅牢性も必要である。
本研究では,DeepLabv3モデルを用いて,iPS(iPS)細胞コロニーのセグメンテーションにおいて高い性能を達成できることを示す。
これらの結果は、微妙で低コントラスト境界を特徴とする特殊タスクに対して、モデル複雑性の増加が必ずしもより良いパフォーマンスをもたらすとは限らないことを示唆している。
我々の研究は、常により大きく、より一般化されたアーキテクチャが常に好ましいという仮定を再考し、よりシンプルなモデルが、ドメイン固有のバイオメディカルアプリケーションにおいて、強力な精度と実用的な信頼性を提供するという証拠を提供する。
我々はまた、再生医療や関連分野のセマンティックセグメンテーションのさらなる進歩を支援することを目的として、小さなデータセットとドメイン固有のエンコーディング戦略を含むオープンソース実装も提供する。
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