論文の概要: MEG-GPT: A transformer-based foundation model for magnetoencephalography data
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.18080v1
- Date: Mon, 20 Oct 2025 20:18:38 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-25 03:08:12.554463
- Title: MEG-GPT: A transformer-based foundation model for magnetoencephalography data
- Title(参考訳): MEG-GPT:脳磁図データのためのトランスフォーマーベース基礎モデル
- Authors: Rukuang Huang, Sungjun Cho, Chetan Gohil, Oiwi Parker Jones, Mark Woolrich,
- Abstract要約: 近年のディープラーニングの進歩は、言語や視覚などの他の領域において、大規模に基礎モデルを使用することで、大きな進歩をもたらした。
本稿では,時間アテンションと次の時間ポイント予測を用いたトランスフォーマーベース基盤モデルMEG-GPTを紹介する。
我々は大規模なMEGデータセットから抽出したトークン化された脳領域の時間軸についてMEG-GPTを訓練した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.336623115095147
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Modelling the complex spatiotemporal patterns of large-scale brain dynamics is crucial for neuroscience, but traditional methods fail to capture the rich structure in modalities such as magnetoencephalography (MEG). Recent advances in deep learning have enabled significant progress in other domains, such as language and vision, by using foundation models at scale. Here, we introduce MEG-GPT, a transformer based foundation model that uses time-attention and next time-point prediction. To facilitate this, we also introduce a novel data-driven tokeniser for continuous MEG data, which preserves the high temporal resolution of continuous MEG signals without lossy transformations. We trained MEG-GPT on tokenised brain region time-courses extracted from a large-scale MEG dataset (N=612, eyes-closed rest, Cam-CAN data), and show that the learnt model can generate data with realistic spatio-spectral properties, including transient events and population variability. Critically, it performs well in downstream decoding tasks, improving downstream supervised prediction task, showing improved zero-shot generalisation across sessions (improving accuracy from 0.54 to 0.59) and subjects (improving accuracy from 0.41 to 0.49) compared to a baseline methods. Furthermore, we show the model can be efficiently fine-tuned on a smaller labelled dataset to boost performance in cross-subject decoding scenarios. This work establishes a powerful foundation model for electrophysiological data, paving the way for applications in computational neuroscience and neural decoding.
- Abstract(参考訳): 大規模脳力学の複雑な時空間パターンをモデル化することは神経科学にとって重要であるが、従来の手法では磁気脳磁図(MEG)のような複雑な構造を捉えることができない。
近年のディープラーニングの進歩は、言語や視覚などの他の領域において、大規模に基礎モデルを使用することで、大きな進歩をもたらした。
本稿では,時間アテンションと次の時間ポイント予測を用いたトランスフォーマーベース基盤モデルMEG-GPTを紹介する。
これを容易にするために,連続MEG信号の高時間分解能を損なうことなく保持する連続MEGデータのための新しいデータ駆動トークンサも導入する。
我々は,大規模なMEGデータセット(N=612,アイクロースレスト,Cam-CANデータ)から抽出したトークン化された脳領域の時間軸に基づいてMEG-GPTを訓練し,過渡事象や集団変動など,現実的な時空間特性を持つデータを生成することを示す。
重要な点として、下流の復号化タスクにおいてよく機能し、下流の教師付き予測タスクを改善し、セッション間のゼロショットの一般化を改善した(精度が0.54から0.59に向上した)。
さらに,より小さなラベル付きデータセット上でモデルを効率的に微調整し,オブジェクト間デコーディングのシナリオにおける性能を向上させることも示す。
この研究は、電気生理学的データのための強力な基礎モデルを確立し、計算神経科学や神経復号への応用の道を開く。
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