論文の概要: Shape Modeling with Spline Partitions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2108.02507v1
- Date: Thu, 5 Aug 2021 10:33:05 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-08-06 20:06:15.168166
- Title: Shape Modeling with Spline Partitions
- Title(参考訳): スプライン分割による形状モデリング
- Authors: Shufei Ge, Shijia Wang, Lloyd Elliott
- Abstract要約: 本稿では,曲線で領域を分割する並列化ベイズ非パラメトリック手法を提案する。
我々はHIV-1感染したヒトマクロファージ画像データセットに本手法を適用し、また、我々のアプローチを説明するためのデータセットのシミュレーションを行った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.222802562733787
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Shape modelling (with methods that output shapes) is a new and important task
in Bayesian nonparametrics and bioinformatics. In this work, we focus on
Bayesian nonparametric methods for capturing shapes by partitioning a space
using curves. In related work, the classical Mondrian process is used to
partition spaces recursively with axis-aligned cuts, and is widely applied in
multi-dimensional and relational data. The Mondrian process outputs
hyper-rectangles. Recently, the random tessellation process was introduced as a
generalization of the Mondrian process, partitioning a domain with non-axis
aligned cuts in an arbitrary dimensional space, and outputting polytopes.
Motivated by these processes, in this work, we propose a novel parallelized
Bayesian nonparametric approach to partition a domain with curves, enabling
complex data-shapes to be acquired. We apply our method to HIV-1-infected human
macrophage image dataset, and also simulated datasets sets to illustrate our
approach. We compare to support vector machines, random forests and
state-of-the-art computer vision methods such as simple linear iterative
clustering super pixel image segmentation. We develop an R package that is
available at
\url{https://github.com/ShufeiGe/Shape-Modeling-with-Spline-Partitions}.
- Abstract(参考訳): 形状モデリング(形状を出力する手法)は、ベイズ非パラメトリックスやバイオインフォマティクスにおける新しい重要な課題である。
本研究では,曲線を用いて空間を分割して形状を捉えるベイズ非パラメトリック法に着目した。
関連する研究において、古典的なモンドリアン過程は、空間を軸に整列した切断で再帰的に分割するために使われ、多次元および関係データに広く適用される。
モンドリアン過程は超矩形を出力する。
近年、ランダムなテッセル化過程がモンドリアン過程の一般化として導入され、任意の次元空間で非軸整列切断された領域を分割し、ポリトープを出力した。
本稿では,これらのプロセスに動機づけられ,曲線を持つ領域を分割する並列化ベイズ型非パラメトリック手法を提案する。
本手法をhiv-1感染ヒトマクロファージ画像データセットに適用し,本手法をシミュレートした。
サポートベクターマシン,ランダムフォレスト,および単純な線形反復クラスタリングスーパーピクセル画像セグメンテーションのような最先端のコンピュータビジョン手法と比較する。
我々は, \url{https://github.com/ShufeiGe/Shape-Modeling-with-Spline-Partitions} で利用可能な R パッケージを開発した。
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