論文の概要: Physics-based machine learning for modeling stochastic IP3-dependent
calcium dynamics
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.05053v1
- Date: Fri, 10 Sep 2021 18:33:24 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2021-09-14 15:11:04.254834
- Title: Physics-based machine learning for modeling stochastic IP3-dependent
calcium dynamics
- Title(参考訳): 確率IP3依存性カルシウムダイナミクスモデリングのための物理ベース機械学習
- Authors: Oliver K. Ernst, Tom Bartol, Terrence Sejnowski, Eric Mjolsness
- Abstract要約: 本手法は,反応ネットワークのシミュレーションから有効確率分布と微分方程式モデルを推定する。
縮小された記述と微細な記述の密接な関係は、マスター方程式から導かれる近似を学習問題に導入することを可能にする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: We present a machine learning method for model reduction which incorporates
domain-specific physics through candidate functions. Our method estimates an
effective probability distribution and differential equation model from
stochastic simulations of a reaction network. The close connection between
reduced and fine scale descriptions allows approximations derived from the
master equation to be introduced into the learning problem. This representation
is shown to improve generalization and allows a large reduction in network size
for a classic model of inositol trisphosphate (IP3) dependent calcium
oscillations in non-excitable cells.
- Abstract(参考訳): 本稿では,候補関数によるドメイン固有物理を組み込んだモデル縮小のための機械学習手法を提案する。
本手法は,反応ネットワークの確率シミュレーションから有効確率分布と微分方程式モデルを推定する。
縮小記述と細スケール記述の密接な関係は、マスター方程式から導かれる近似を学習問題に導入することを可能にする。
この表現は一般化を改善できることが示されており、イノシトール三リン酸(ip3)依存性カルシウム振動の古典的なモデルではネットワークサイズが大幅に削減される。
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