論文の概要: Systems Biology: Identifiability analysis and parameter identification
via systems-biology informed neural networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2202.01723v1
- Date: Thu, 3 Feb 2022 17:40:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-02-04 15:18:10.073730
- Title: Systems Biology: Identifiability analysis and parameter identification
via systems-biology informed neural networks
- Title(参考訳): システム生物学:システム生物学情報ニューラルネットワークによる識別可能性分析とパラメータ同定
- Authors: Mitchell Daneker and Zhen Zhang and George Em Karniadakis and Lu Lu
- Abstract要約: 本稿では,パラメータ推定のためのシステム生物学情報ニューラルネットワークを提案する。
また,パラメータの識別可能性を分析するために,構造的および実用的識別可能性分析についても述べる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.104519140921464
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The dynamics of systems biological processes are usually modeled by a system
of ordinary differential equations (ODEs) with many unknown parameters that
need to be inferred from noisy and sparse measurements. Here, we introduce
systems-biology informed neural networks for parameter estimation by
incorporating the system of ODEs into the neural networks. To complete the
workflow of system identification, we also describe structural and practical
identifiability analysis to analyze the identifiability of parameters. We use
the ultridian endocrine model for glucose-insulin interaction as the example to
demonstrate all these methods and their implementation.
- Abstract(参考訳): システム生物学的プロセスのダイナミクスは、通常、ノイズやスパースの測定から推測する必要がある多くの未知のパラメータを持つ通常の微分方程式(ODE)のシステムによってモデル化される。
本稿では,ODEのシステムをニューラルネットワークに組み込んだパラメータ推定のためのシステム生物学情報ニューラルネットワークを提案する。
システム同定のワークフローを完成するために,パラメータの識別性を分析するための構造的かつ実用的な識別可能性解析についても述べる。
糖-インスリン相互作用の例として, ウリジアン・エンドクリンモデルを用いて, これらの方法とその実装を実証する。
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