論文の概要: GAUCHE: A Library for Gaussian Processes in Chemistry
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2212.04450v1
- Date: Tue, 6 Dec 2022 08:28:21 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-12-09 16:50:51.943066
- Title: GAUCHE: A Library for Gaussian Processes in Chemistry
- Title(参考訳): GAUCHE:ガウス化学プロセスのための図書館
- Authors: Ryan-Rhys Griffiths and Leo Klarner and Henry B. Moss and Aditya
Ravuri and Sang Truong and Bojana Rankovic and Yuanqi Du and Arian Jamasb and
Julius Schwartz and Austin Tripp and Gregory Kell and Anthony Bourached and
Alex Chan and Jacob Moss and Chengzhi Guo and Alpha A. Lee and Philippe
Schwaller and Jian Tang
- Abstract要約: 本稿では,CHEmistryにおけるGAUssianプロセスのライブラリであるGAUCHEを紹介する。
分子発見および化学反応最適化におけるGAUCHEの応用について紹介する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.949599858323023
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We introduce GAUCHE, a library for GAUssian processes in CHEmistry. Gaussian
processes have long been a cornerstone of probabilistic machine learning,
affording particular advantages for uncertainty quantification and Bayesian
optimisation. Extending Gaussian processes to chemical representations,
however, is nontrivial, necessitating kernels defined over structured inputs
such as graphs, strings and bit vectors. By defining such kernels in GAUCHE, we
seek to open the door to powerful tools for uncertainty quantification and
Bayesian optimisation in chemistry. Motivated by scenarios frequently
encountered in experimental chemistry, we showcase applications for GAUCHE in
molecular discovery and chemical reaction optimisation. The codebase is made
available at https://github.com/leojklarner/gauche
- Abstract(参考訳): 本稿では,CHEmistryにおけるGAUssianプロセスのライブラリであるGAUCHEを紹介する。
ガウス過程は確率論的機械学習の基盤であり、不確実な定量化とベイズ最適化に特に利点がある。
しかし、ガウス過程を化学表現に拡張することは非自明であり、グラフ、文字列、ビットベクトルといった構造化入力上で定義される核を必要とする。
このようなカーネルをGAUCHEで定義することにより、不確実な定量化とベイズ最適化のための強力なツールへの扉を開くことを目指す。
実験化学において頻繁に発生するシナリオによって動機付けられ,分子発見および化学反応最適化におけるGAUCHEの応用を示す。
コードベースはhttps://github.com/leojklarner/gaucheで利用可能である。
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