論文の概要: Causal Graph Recovery in Neuroimaging through Answer Set Programming
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2506.09286v1
- Date: Tue, 10 Jun 2025 22:51:30 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-06-13 06:35:02.142661
- Title: Causal Graph Recovery in Neuroimaging through Answer Set Programming
- Title(参考訳): 解答セットプログラミングによるニューロイメージングにおける因果グラフの回復
- Authors: Mohammadsajad Abavisani, Kseniya Solovyeva, David Danks, Vince Calhoun, Sergey Plis,
- Abstract要約: 制約最適化アプローチ、特に解集合プログラミング(ASP)を用いて、最適な解集合を見つける。
ASPは、最も可能性の高い基盤グラフを識別するだけでなく、専門家の選択のための可能なグラフの同値クラスも提供する。
提案手法は,F1スコアを平均12%向上させるため,確立された手法の上にメタアプローチとして適用可能であることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.762303951933521
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Learning graphical causal structures from time series data presents significant challenges, especially when the measurement frequency does not match the causal timescale of the system. This often leads to a set of equally possible underlying causal graphs due to information loss from sub-sampling (i.e., not observing all possible states of the system throughout time). Our research addresses this challenge by incorporating the effects of sub-sampling in the derivation of causal graphs, resulting in more accurate and intuitive outcomes. We use a constraint optimization approach, specifically answer set programming (ASP), to find the optimal set of answers. ASP not only identifies the most probable underlying graph, but also provides an equivalence class of possible graphs for expert selection. In addition, using ASP allows us to leverage graph theory to further prune the set of possible solutions, yielding a smaller, more accurate answer set significantly faster than traditional approaches. We validate our approach on both simulated data and empirical structural brain connectivity, and demonstrate its superiority over established methods in these experiments. We further show how our method can be used as a meta-approach on top of established methods to obtain, on average, 12% improvement in F1 score. In addition, we achieved state of the art results in terms of precision and recall of reconstructing causal graph from sub-sampled time series data. Finally, our method shows robustness to varying degrees of sub-sampling on realistic simulations, whereas other methods perform worse for higher rates of sub-sampling.
- Abstract(参考訳): 時系列データからグラフィカルな因果構造を学習することは、特に測定周波数がシステムの因果時間スケールと一致しない場合、大きな課題となる。
これはしばしば、サブサンプリングからの情報損失(すなわち、時間を通してシステムのすべての可能な状態を観察しない)により、同様に可能な因果グラフの集合につながる。
本研究は、因果グラフの導出にサブサンプリングの効果を取り入れ、より正確で直感的な結果をもたらすことにより、この問題に対処する。
制約最適化アプローチ、特に解集合プログラミング(ASP)を用いて、最適な解集合を見つける。
ASPは、最も可能性の高い基盤グラフを識別するだけでなく、専門家の選択のための可能なグラフの同値クラスも提供する。
さらに、ASPを使用することで、グラフ理論を活用して、可能なソリューションの集合をさらに刺激し、従来のアプローチよりもはるかに小さく、より正確な回答セットを得ることができます。
シミュレーションデータと経験的構造的脳の接続性の両方にアプローチを検証し,これらの実験において確立された手法よりも優れていることを示す。
さらに,F1スコアを平均12%向上させるため,確立された手法の上にメタアパッチを組み込むことが可能であることを示す。
さらに、サブサンプル時系列データから因果グラフを復元する精度とリコールの観点から、最先端の結果を得た。
最後に,本手法は,現実的なシミュレーションにおいて,サブサンプリングの度合いの変動に対してロバスト性を示す一方,他の手法では,サブサンプリングの速度が向上することを示す。
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