論文の概要: Wasserstein K-Means for Clustering Tomographic Projections
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2010.09989v1
- Date: Tue, 20 Oct 2020 03:28:17 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2022-10-05 07:40:35.295661
- Title: Wasserstein K-Means for Clustering Tomographic Projections
- Title(参考訳): クラスタリングトモグラフィ投影のためのWasserstein K-Means
- Authors: Rohan Rao, Amit Moscovich, Amit Singer
- Abstract要約: 画像に対する回転不変ワッサーシュタイン計量に基づくk-meansアルゴリズムを提案する。
高速線形時間近似(英語版)(Wasserstein-1 metric)、またはアースモーバー距離(Earthmover's distance)を用いることにより、計算オーバーヘッドはほとんどない。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.878995336760916
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Motivated by the 2D class averaging problem in single-particle cryo-electron
microscopy (cryo-EM), we present a k-means algorithm based on a
rotationally-invariant Wasserstein metric for images. Unlike existing methods
that are based on Euclidean ($L_2$) distances, we prove that the Wasserstein
metric better accommodates for the out-of-plane angular differences between
different particle views. We demonstrate on a synthetic dataset that our method
gives superior results compared to an $L_2$ baseline. Furthermore, there is
little computational overhead, thanks to the use of a fast linear-time
approximation to the Wasserstein-1 metric, also known as the Earthmover's
distance.
- Abstract(参考訳): 単粒子核電子顕微鏡(cryo-em)における2次元平均化問題に動機づけられ,画像の回転不変ワッサースタイン計量に基づくk平均法を提案する。
ユークリッド(L_2$)距離に基づく既存の方法とは異なり、ワッサーシュタイン計量は異なる粒子ビュー間の平面外角差に適合することが証明されている。
本手法は合成データセットにおいて,$l_2$のベースラインと比較して優れた結果が得られることを示す。
さらに、アースモーバー距離(earthmover's distance)として知られるwasserstein-1メトリックの高速線形時間近似を用いることで、計算オーバーヘッドがほとんどなくなる。
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