論文の概要: Recurrences reveal shared causal drivers of complex time series
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2301.13516v1
- Date: Tue, 31 Jan 2023 10:07:23 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2023-02-01 16:56:01.945278
- Title: Recurrences reveal shared causal drivers of complex time series
- Title(参考訳): 複雑時系列における因果関係の共有化
- Authors: William Gilpin
- Abstract要約: 本稿では,時系列測定における繰り返しを用いた教師なし学習アルゴリズムを導入し,観測されていない運転信号を徐々に再構築する。
我々は,神経科学,ゲノム学,流体力学,生理学にまたがる様々な実世界のデータセットから因果的駆動信号を抽出する手法の強い能力を実証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 6.09170287691728
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Many experimental time series measurements share an unobserved causal driver.
Examples include genes targeted by transcription factors, ocean flows
influenced by large-scale atmospheric currents, and motor circuits steered by
descending neurons. Reliably inferring this unseen driving force is necessary
to understand the intermittent nature of top-down control schemes in diverse
biological and engineered systems. Here, we introduce a new unsupervised
learning algorithm that uses recurrences in time series measurements to
gradually reconstruct an unobserved driving signal. Drawing on the mathematical
theory of skew-product dynamical systems, we identify recurrence events shared
across response time series, which implicitly define a recurrence graph with
glass-like structure. As the amount or quality of observed data improves, this
recurrence graph undergoes a percolation transition manifesting as weak
ergodicity breaking for random walks on the induced landscape -- revealing the
shared driver's dynamics, even in the presence of strongly corrupted or noisy
measurements. Across several thousand random dynamical systems, we empirically
quantify the dependence of reconstruction accuracy on the rate of information
transfer from a chaotic driver to the response systems, and we find that
effective reconstruction proceeds through gradual approximation of the driver's
dominant unstable periodic orbits. Through extensive benchmarks against
classical and neural-network-based signal processing techniques, we demonstrate
our method's strong ability to extract causal driving signals from diverse
real-world datasets spanning neuroscience, genomics, fluid dynamics, and
physiology.
- Abstract(参考訳): 多くの実験時系列測定は観測されていない因果ドライバを共有している。
例えば、転写因子を標的とする遺伝子、大規模な大気電流に影響された海洋の流れ、下降するニューロンが支配する運動回路などがある。
多様な生物学的・工学的なシステムにおけるトップダウン制御スキームの断続的な性質を理解するためには、この未知の駆動力を確実に推論する必要がある。
そこで本研究では,時系列測定の繰り返しを利用して,観測されていない運転信号を徐々に再構成する,教師なし学習アルゴリズムを提案する。
スクリュー生成力学系の数学的理論に基づいて,反応時間列間で共有される再発事象を同定し,ガラスのような構造を持つ再発グラフを暗黙的に定義する。
観測されたデータの量や品質が向上するにつれて、この再帰グラフは、誘導されたランドスケープ上のランダムウォークの弱いエルゴード性破壊として現れるパーコレーション遷移を実行します。
数千のランダムな力学系において、カオスドライバから応答系への情報伝達速度に対する再構成精度の依存性を実証的に定量化し、運転者の支配的不安定周期軌道の漸進的近似によって効果的な再構成が進行することを示す。
古典的およびニューラルネットワークに基づく信号処理技術に対する広範なベンチマークを通じて,神経科学,ゲノム学,流体力学,生理学にまたがる多種多様な実世界データセットから因果的駆動信号を抽出する手法の強みを実証する。
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