論文の概要: Scalable unsupervised alignment of general metric and non-metric structures
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2406.13507v1
- Date: Wed, 19 Jun 2024 12:54:03 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-06-21 19:43:36.558982
- Title: Scalable unsupervised alignment of general metric and non-metric structures
- Title(参考訳): 一般計量および非計量構造のスケーラブルな非教師なしアライメント
- Authors: Sanketh Vedula, Valentino Maiorca, Lorenzo Basile, Francesco Locatello, Alex Bronstein,
- Abstract要約: 異なるドメインからのデータのアライメントは、非常に異なる領域にわたる幅広いアプリケーションによる機械学習の基本的な問題である。
我々は、2次代入問題 (QAP) の最小化問題でもある、関連よく計算可能な線形代入問題 (LAP) を学習する。
単一セルマルチオミクスとニューラル潜在空間からの合成および実データに対するアプローチを評価する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 21.29255788365408
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Aligning data from different domains is a fundamental problem in machine learning with broad applications across very different areas, most notably aligning experimental readouts in single-cell multiomics. Mathematically, this problem can be formulated as the minimization of disagreement of pair-wise quantities such as distances and is related to the Gromov-Hausdorff and Gromov-Wasserstein distances. Computationally, it is a quadratic assignment problem (QAP) that is known to be NP-hard. Prior works attempted to solve the QAP directly with entropic or low-rank regularization on the permutation, which is computationally tractable only for modestly-sized inputs, and encode only limited inductive bias related to the domains being aligned. We consider the alignment of metric structures formulated as a discrete Gromov-Wasserstein problem and instead of solving the QAP directly, we propose to learn a related well-scalable linear assignment problem (LAP) whose solution is also a minimizer of the QAP. We also show a flexible extension of the proposed framework to general non-metric dissimilarities through differentiable ranks. We extensively evaluate our approach on synthetic and real datasets from single-cell multiomics and neural latent spaces, achieving state-of-the-art performance while being conceptually and computationally simple.
- Abstract(参考訳): 異なるドメインからのデータのアライメントは、非常に異なる領域にわたる幅広いアプリケーションを持つ機械学習において、基本的な問題である。
数学的には、この問題は距離のような対量の不一致の最小化として定式化することができ、グロモフ=ハウスドルフとグロモフ=ワッサーシュタイン距離に関係している。
計算学的には、NPハードであることが知られている二次代入問題(QAP)である。
以前の研究は、列列のエントロピーやローランクの正規化でQAPを直接解こうとしたが、これはわずかにサイズの入力に対してのみ計算的に抽出可能であり、整列しているドメインに関連する限られた帰納バイアスのみをエンコードする。
離散Gromov-Wasserstein問題として定式化された計量構造のアライメントを考察し、QAPを直接解く代わりに、QAPの最小値である解である関連するよく計算可能な線形代入問題(LAP)を学ぶことを提案する。
また、このフレームワークを、微分可能なランクによる一般的な非メトリックな相違点に柔軟に拡張することを示す。
単一セルマルチオミクスとニューラル潜在空間からの合成および実データセットに対する我々のアプローチを広範に評価し、概念的かつ計算学的に単純でありながら最先端の性能を達成する。
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