論文の概要: Entropic Matching for Expectation Propagation of Markov Jump Processes
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2309.15604v2
- Date: Mon, 17 Mar 2025 09:52:50 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-03-18 12:33:40.740558
- Title: Entropic Matching for Expectation Propagation of Markov Jump Processes
- Title(参考訳): マルコフジャンプ過程の期待伝播に対するエントロピーマッチング
- Authors: Yannick Eich, Bastian Alt, Heinz Koeppl,
- Abstract要約: 我々はマルコフジャンププロセスのための新しい、引き込み可能な潜在推論スキームを提案する。
我々のアプローチは、よく知られた予測伝搬アルゴリズムに組み込むことができるエントロピーマッチングフレームワークに基づいている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 31.376561087029454
- License:
- Abstract: We propose a novel, tractable latent state inference scheme for Markov jump processes, for which exact inference is often intractable. Our approach is based on an entropic matching framework that can be embedded into the well-known expectation propagation algorithm. We demonstrate the effectiveness of our method by providing closed-form results for a simple family of approximate distributions and apply it to the general class of chemical reaction networks, which are a crucial tool for modeling in systems biology. Moreover, we derive closed-form expressions for point estimation of the underlying parameters using an approximate expectation maximization procedure. We evaluate our method across various chemical reaction networks and compare it to multiple baseline approaches, demonstrating superior performance in approximating the mean of the posterior process. Finally, we discuss the limitations of our method and potential avenues for future improvement, highlighting its promising direction for addressing complex continuous-time Bayesian inference problems.
- Abstract(参考訳): 本稿では,マルコフジャンププロセスに対して,正確な推論がしばしば難易度の高い新しい遅延状態推論スキームを提案する。
我々のアプローチは、よく知られた予測伝搬アルゴリズムに組み込むことができるエントロピーマッチングフレームワークに基づいている。
簡単な近似分布の族に対して閉形式結果を提供することにより,本手法の有効性を実証し,システム生物学において重要なモデリングツールである化学反応ネットワークの一般クラスに適用する。
さらに、近似予測最大化法を用いて、基礎となるパラメータの点推定のための閉形式式を導出する。
本手法を各種化学反応ネットワーク上で評価し, 提案手法を複数のベースライン法と比較し, 後続過程の平均を近似する上で, 優れた性能を示す。
最後に,提案手法の限界と今後の改善への可能性について考察し,複雑な連続時間ベイズ推論問題に対処するための今後の方向性を明らかにする。
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